Frank Black, ancien agent du FBI, et analyste réputé dans les crimes sexuels et violents, ayant développé la faculté (malédiction pour lui) de voir avec les yeux du tueur, fuit son ancienne vie et s’installe avec sa famille à Seattle. Mais des photos prises par un inconnu à Washington de sa femme Catherine, et de sa fille Jordan, arrivent à leur nouvelle maison. Frank rejoint alors un mystérieux groupe millénariste, le "Groupe Millennium", composé d’anciens de la police, du FBI et d’autres agences pour utiliser à bon escient son "don" et traquer les meurtriers.